Ja es coneixen les 32 eliminatòries que donaran a conèixer els equips que entraran a la Fase de Grups de la Conference League, competició en el qual participarà el Villarreal CF. Vint-i-dos són del play off de la Conference i les altres deu de l'Europa League els perdedors de la qual passaran a la Conference.
Ruta dels campions
NK Maribor (SVN) – Cfr 1907 Cluj (ROU)
RFS (LVA) – Linfield FC (NIR)
KKS Lech Poznań (POL) – F91 Diddeleng (LUX)
FC Shkupi 1927 (MKD) – Ballkani (KOS)
HŠK Zrinjski (BIH) – ŠK Slovan Bratislava (SVK)
Ruta principal
PFC CSKA-Sofia (BUL) – FC Basilea 1893 (SUI)
FC Vaduz (MENTIR) – SK Rapid Wien (O)
Raków Czestochowa (POL) – SK Slavia Praha (NS)
APOEL FC (CYP) – Djurgårdens IF (SWE)
Maccabi Tel-Aviv FC (ISR) – OGC Niça (DE)
Universitatea Craiova (ROU) – Hapoel Beer-Sheva FC (ISR)
İstanbul Başakşehir FK (Allà) – Reial Anvers FC (BONA)
Fotbal Club FCSB (ROU) – Viking FK (NOR)
FK Partizan (SRB) – Hamrun Spartans FC (MLT)
ACF Fiorentina (ITA) – FC Twente (NED)
Vila-real CF (ESP) – HNK Hajduk Split (CRO)
1. FC Köln (GER) – Fehérvár FC (HUN)
West Ham United FC (ENG) – Viborg FF (EL)
BSC Young Boys (SUI) – RSC Anderlecht (BONA)
1. FC Slovácko (NS) – AIK (SWE)
Molde FK (NOR) – Wolfsberger AC (O)
AZ Alkmaar (NED) – Gil Vicente FC (PER)
Caps de sèrie en negreta.
Play off Europa League: L'equip eliminat passa a la Fase de Grups de la Conference League
Dnipro-1 (UKR) – AEK Larnaca FC (CYP)
KAA Gent (BONA) – Omonoia FC (CYP)
FK Àustria Wien (O) – Fenerbahçe SK (Allà)
FC Zuric (SUI) – Heart of Midlothian FC (SCO)
HJK Hèlsinki (FINAL) – Silkeborg IF (EL)
Malmö FF (SWE) – Sivasspor (Allà)
Ferencvárosi TC (HUN) – Shamrock Rovers FC (IRL)
Apollon Limassol FC (CYP) – Olympiacos FC (GRE)
FC Pyunik (BRAÇ) – FC Sheriff Tiraspol (MDA)
PFC Ludogorets 1945 (BUL) – FK Žalgiris Vilnius (LTU)
